蓝藻包括以下几种藻类：

蓝球藻（Chroococcus）

颤藻（Oscillatoria）

念珠藻（Nostoc）

发菜（Nostoc flagelliforme）

这些蓝藻在地球上大约出现距今35~33亿年前，已知蓝藻约2000种，中国已有记录的约900种。蓝藻门分为两纲：色球藻纲和藻殖段纲。色球藻纲藻体为单细胞体或群体；藻殖段纲藻体为丝状体，有藻殖段。蓝藻不具叶绿体、线粒体、高尔基体、中心体、内质网和液泡等细胞器，细胞器是核糖体。含叶绿素a，无叶绿素b，含数种叶黄素和胡萝卜素，还含有藻胆素（是藻红素、藻蓝素和别藻蓝素的总称）。